O município de Joanópolis tem cumprido os protocolos determinados pelo Plano São Paulo, relativos à flexibilização da quarentena e a retomada consciente das atividades. Porém, a antecipação de feriados na capital São Paulo e Região Bragantina, que propicia a visitação e turismo mesmo em tempos pandêmicos ocasionaram novas medidas de prevenção ao aumento populacional e o enfrentamento e prevenção de contágio de coronavírus.